社伝によると、古老の口伝承として、すぐ近くの篠畑神社に天照大神の神霊が遷されたとき(佐佐波多宮)、摂社として豊耜入姫命と倭姫命を摂社として祀ったが、後の時代に誤って天照大神となったとあります。江戸末期に洪水で社殿が流され当地に遷座されたようです。その際に｢九頭大明神｣と書かれた棟札が見つかり、原初のご祭神が九頭龍神であったことが分かりました。現在は境内の垣内磐座神社として祀られています。

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