高市郡の南西端、御所市戸毛(とうげ)と境にする｢丹生谷｣に鎮座。｢戸毛｣は｢丹生谷｣との｢峠｣からの転訛かと思われます。当社は丹生都姫命巡行の候補地の一。丹生都比賣神社に伝わる｢天野告門(あまののりと)｣という平安時代の書に、紀伊国伊都郡｢奄太村石口(いわくち)｣に降臨、次いで｢川上水分ノ峯ニ上リ坐シテ｣とあり、さらに｢下リ坐シテ十市ノ郡布々支丹生ニ忌杖刺シ給ヒ 下リ坐シテ巨勢ノ丹生ニ忌杖刺シ給ヒ 下リ坐シテ宇智ノ郡布々支丹生ニ忌杖刺シ給ヒ｣とあります。｢川上水分ノ峯ニ上リ坐シテ｣というのが丹生川上神社 中社に比定。｢十市ノ郡布々支丹生｣が明日香村入谷の大仁保に比定。そして｢巨勢ノ丹生｣が当社に比定。さらに｢宇智ノ郡布々支丹生｣が丹生川神社に比定されています。また紀の皇極天皇三年(644年)の条に｢蘇我大臣蝦夷は長直(ナガノアタイ)を大丹穂山に遣はして桙削寺を造らせた｣とあり、｢大丹穂山｣が当地に推定されています。こちらは諸説あるようで明日香村入谷の大仁保神社もその一つ。

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